Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAF2Q96CS3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms