Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms