Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms