Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFKQ969G6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms