Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCAMP4Q969E2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms