Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF4BQ92750 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF4BQ92750 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms