Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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PTPRUQ92729 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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PTPRUQ92729 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRUQ92729 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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