Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms