Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms