Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH3Q8TE77 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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