Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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