Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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