Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms