Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms