Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PNLDC1Q8NA58 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PNLDC1Q8NA58 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms