Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00612Q8N6U2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms