Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNE4Q8N205 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNE4Q8N205 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms