Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf40Q8IXQ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf40Q8IXQ3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf40Q8IXQ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf40Q8IXQ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf40Q8IXQ3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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