Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms