Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms