Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00523Q86TU6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms