Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms