Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms