Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HECW1Q76N89 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms