Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM43BQ6ZT52 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms