Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC141Q6ZP82 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC141Q6ZP82 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms