Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms