Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms