Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD54Q6NXT1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms