Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms