Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225Q6GV28 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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