Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms