Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHEQ5VZ18 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms