Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms