Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EIPR1Q53HC9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms