Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms