Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms