Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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