Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms