Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSG1Q2KHT4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms