Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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