Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CA9Q16790 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CA9Q16790 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CA9Q16790 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms