Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASIC2Q16515 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASIC2Q16515 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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