Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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