Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN9AQ15858 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SCN9AQ15858 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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