Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF2Q15853 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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