Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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VAMP3Q15836 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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VAMP3Q15836 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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VAMP3Q15836 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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VAMP3Q15836 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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