Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATXN8Q156A1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms