Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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