Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms